Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms