Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms