Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTA3Q9BTC8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms