Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms