Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms