Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPOCK3Q9BQ16 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPOCK3Q9BQ16 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPOCK3Q9BQ16 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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