Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms