Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM11Q96F44 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms