Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.7 ms