Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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