Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP13Q92995 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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