Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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UBA3Q8TBC4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA3Q8TBC4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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