Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms