Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms