Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms