Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms