Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.6 ms