Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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