Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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SP6Q3SY56 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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SP6Q3SY56 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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SP6Q3SY56 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SP6Q3SY56 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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