Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD9Q3L8U1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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CHD9Q3L8U1 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD9Q3L8U1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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