Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL38Q2WGJ6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms