Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms