Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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