Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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