Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZFHX3Q15911 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZFHX3Q15911 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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