Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms