Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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