Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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