Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms