Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms