Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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