Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 IRF5-201ENST00000249375 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms