Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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