Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms