Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms