Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms