Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms