Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms