Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms