Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms