Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms