Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms