Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms