Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP4P49662 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms