Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ME1P48163 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms