Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BMI1P35226 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms