Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCKARP32238 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CCKARP32238 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CCKARP32238 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms