Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms