Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRGP23470 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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