Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN8P19075 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms